そして、名古屋（愛知県尋常師範学校内に設置、愛知県名古屋測候所に観測委託）と仙台（第二高等中学校）とに恒温観測室を設け、そこに磁力計を設置して、明治26年(1893)から連続観測を始めた。

その後、根室（根室測候所）と熊本（第五高等学校）とでも、マスカール式自記磁力計を設置して観測を開始した。これらの観測の開始時期は不祥であるが、根室は明治29年(1896)、熊本は明治30年(1897)（明治32年(1899)という説もある）に観測を開始したものと推測される。

従って、当時、中央気象台による東京での観測と合わせて、国内の合計５ヵ所で地磁気観測がなされていたことになる。